Celem działania Federacji jest

1. 1. Przeciwdziałanie dyskryminacji, przede wszystkim ze względu na płeć i seksualność.
   2. Krzewienie tolerancji, przełamywanie uprzedzeń i stereotypów, zwłaszcza wobec osób LGBTQ (lesbijek, gejów, osób biseksualnych, transpłciowych i queerowych.
   3. Kształtowanie i integracja społeczności osób LGBTQ.
   4. Budowanie społeczeństwa obywatelskiego otwartego na różnorodność.
   5. Ochrona praw człowieka i swobód obywatelskich.
   6. Tworzenie i prowadzenie centrów społeczności LGBTQ;.
   7. Wspieranie działalności organizacji członkowskich
   8. Rzecznictwo w sprawach będących przedmiotem działalności organizacji członkowskich oraz społeczności przez nie reprezentowanych.
   9. Rozwijanie dialogu i współpracy organizacji członkowskich oraz reprezentowanych przez nie społeczności z sektorem publicznym i innymi środowiskami.
   10. Rozwój organizacji pozarządowych i profesjonalizacja ich działalności.
   11. Integracja i rozwój współpracy organizacji pozarządowych.
   12. Wzmacnianie wizerunku organizacji pozarządowych oraz kształtowanie sprzyjającego dla nich otoczenia.
   13. Nawiązywanie współpracy i wymiany doświadczeń z partnerami krajowymi i zagranicznymi.
   14. Działania na rzecz umacniania w Polsce i w Unii Europejskiej ochrony danych osobowych, w szczególności ochrony danych osobowych członków społeczności LBGT.